1.Bader电荷分析详解
Bader电荷分析详解
Bader电荷分析是源码第一性原理计算中的一个重要工具,首次由Richard Bade在McMaster University提出。源码通过分析计算结果,源码可以精确地获取原子周围的源码电子分布,从而估算原子的源码个人支付源码化合价。
Henkelman课题组开发了一个高效程序,源码2020熊猫影视源码能够处理VASP的源码CHGCAR文件和Gaussian的CUBE文件,支持Linux和MAC OS X平台。源码用户可以下载该程序的源码编译好的可执行文件或源代码自行编译,获取详细信息请访问:theory.cm.utexas.edu/he...
Bader电荷分析的源码基本流程包括:首先进行结构优化,接着基于优化结构进行静态计算,源码并保存为POSCAR格式,源码最后配置INCAR参数进行Bader电荷计算。源码wavemesh的源码下载
Bader电荷有直接计算和精确计算两种方式。源码直接计算通过执行命令“bader chargefile”进行,源码输出文件包括ACF.dat、BCF.dat和AtomVolumes.dat。兼职系统源码下载Bader原子体积可通过指定参数输出,并使用VMD、Jmol、VESTA或支持CUBE文件的星事物模式源码程序如GaussView进行可视化。
精确计算则涉及到VASP的CHGCAR文件处理,该文件仅包含价电荷密度。Bader分析假设电荷密度最大值位于原子中心,但赝势影响了这一假设。VASP中的aeden模块可从PAW计算中输出核心电荷,需要将LAECHG=. true添加至INCAR文件中,生成AECCAR0、AECCAR1、AECCAR2文件。使用chgsum.pl脚本进行求和后,执行命令生成ACF.dat、AVF.dat、BCF.dat文件。正确总电荷的重现需要精细的fft网格,需要通过计算测试NG(X,Y,Z)F方案的可靠性,直至总电荷正确为止。