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2.酵母双杂交(Y2H)延伸系统
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蓝卡拼是什么意思呀
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在现代社会快节奏的拼图拼图生活中,人们的源码源码心理状态往往会受到很大的冲击,因此,越来越多的人开始选择使用蓝卡拼图来放松自己。在拼图的midi程序源码过程中,人们能够深入地思考,并且将所有的注意力都集中到拼图上,从而达到放松心情、减轻焦虑和缓解压力的好处。因此,蓝卡拼图成为了一种现代人们放松身心的好方式。
酵母双杂交(Y2H)延伸系统
各位读者大家好,今天给大家总结下酵母双杂交的多种延伸系统。
酵母双杂交的多种系统原理概括如下图所示,蛋白质X(深蓝色拼图块,诱饵构建体的一部分)和蛋白质Y(浅蓝色拼图块,猎物构建体的一部分)直接相互作用(装配拼图块),从而诱导分裂蛋白质的重建(A、D、E中不同颜色的拼图块)、膜募集(B、C)或蛋白质二聚化(F)。索尼输出源码诱饵或猎物结构中的蛋白质融合显示为拼图块之间的黑色实线。诱饵-猎物相互作用进一步激活下游事件(箭头),直接(A)或间接(B,C,D,F)导致转录激活,或独立于转录激活(D,E),最终产生可筛选的读数,如在特定培养基上的生长或颜色反应。
在受抑制的反式激活因子(RTA)系统中,与经典的Y2H相反,bait-prey相互作用抑制报告基因的转录激活。融合到GAL4-DBD的目的蛋白X是反式的,如转录因子。如果它与融合到转录阻遏物(例如Tup1p)的阻遏结构域(RD)的另一种蛋白质Y相互作用,则报告基因的转录被阻遏。RTA系统已被用于证明哺乳动物碱性螺旋-环-螺旋蛋白MyoD和E之间的十二字源码相互作用,以及原癌基因转录因子c-Myc和推定的肿瘤抑制蛋白Bin1之间的相互作用。它还被用于筛选与多种转录激活因子的新相互作用,包括单纯疱疹病毒1 (HSV-1)调节蛋白VP,c-Myc和雄激素受体。
基于RNA聚合酶III的双杂交(Pol III)系统中,第二个蛋白质Y融合到τp。这种蛋白质是多聚体蛋白质复合物TFIIIC的一个亚单位,TFIIIC是参与RNA聚合酶ⅲ(pol III)介导的转录的两种转录因子之一。如果现在诱饵与含有τp的猎物相互作用,TFIIIC复合物与DNA结合,并招募第二转录因子(TFIIIB)和Pol III。这将激活SNR6报告基因的转录,产生U6 snRNA。在含有温度敏感型U6 snRNA突变体的酵母菌株中,这种报告基因转录将拯救温度敏感型表型,并允许酵母在℃下生长。该系统已用于使用τp-mBRCA1作为诱饵筛选小鼠胚胎cDNA文库。商店免费源码
胞质和膜蛋白Y2H系统中,经典的Y2H和上面介绍的两种替代系统需要相互作用的蛋白质转运到细胞核中,因此不适用于膜相关蛋白、整合膜蛋白和许多其他可溶性胞质蛋白或位于其他亚细胞区室中的蛋白。为了避免这些限制,这些蛋白质的截短形式已经用于Y2H筛选。然而,使用这种截短的蛋白质会导致错误折叠,问题仍然是细胞核不是大多数这些蛋白质的天然环境。这样的问题,在过去可能导致高比率的假阴性,将通过筛选程序来规避,其中相互作用的蛋白质保留在它们的天然细胞区室中。在细胞核外,远离转录机器,反式激活诱饵的使用也不再构成问题。
SOS-和RAS招募系统(SRS和RRS):SOS- and the RAS recruitment systems通过使用RAS信号途径绕过转录读出,RAS信号途径在酵母和哺乳动物之间同源。Ras必须定位在质膜上,通过鸟苷酸交换因子(酵母中的Cdc或哺乳动物中的SOS)进行GDP-GTP交换。这个激活的Ras然后触发下游信号。对于这里描述的Y2H系统,使用Cdc-2温度敏感酵母菌株,其不能在更高的温度(℃)下生长,因为Cdc-2变得无活性并且不能激活Ras信号。温度敏感表型可以通过在Y2H设置中选择性激活Ras来挽救。
G蛋白融合系统可研究完整膜诱饵和可溶性猎物之间的相互作用。后者是一种融合蛋白,具有异源三聚体G蛋白的γ亚单位。如果猎物与位于膜上的诱饵相互作用,它将隔离G蛋白β亚单位,从而破坏异源三聚体G蛋白复合物的形成和随后的下游信号传递。该方法已用于鉴定不能结合突触融合蛋白SNARE复合体的一员)的神经元Sec1突变体。
分裂泛素Y2H技术用于检测胞质蛋白之间发生的蛋白-蛋白相互作用;后来扩展到膜蛋白。泛素可以分成N-末端(Nub)和C-末端(Cub),并且这两部分彼此保持基本的亲和力,因此允许类天然泛素的自发重组。Nub (NubG,NubA)中的点突变(IG或IA)取消了Nub和Cub的这种自发再结合。在这些突变体中,只有通过分别与NubG/A和Cub融合的两种蛋白质的相互作用使两个部分非常接近,才能观察到有效的结合。重建的分裂泛素被USPs识别,然后将任何融合到Cub C末端的报道蛋白切除。最初的系统使用二氢叶酸还原酶作为报告蛋白,其释放通过SDS-PAGE检测。然而,这种读出并不方便,因为它需要免疫沉淀和电泳分离。
基于分裂泛素的系统已经变得非常流行,并且已经成功地应用于cDNA文库筛选和大规模矩阵方法。最近,已经发表了MbY2H系统筛选胞质蛋白质的改编: CytoY2H。这里,诱饵构建体包含Cub和转录因子,并且由于与ER膜蛋白Ost4p的融合而锚定在ER膜上。这允许在膜和/或可溶蛋白中筛选可溶蛋白的相互作用配偶体,以及在核Y2H中为转录激活剂或自激活的蛋白。
SCINEX-P系统允许在ER的氧化环境中分析蛋白质-蛋白质相互作用,利用了酵母未折叠蛋白反应(UPR)的信号。错误折叠的蛋白质在内质网中的积累诱导酵母内质网I型跨膜蛋白(Ire1p)的二聚化,这诱导转录激活因子Hac1p的产生,从而激活伴侣蛋白的转录。在SCINEX-P系统中,感兴趣的蛋白质融合到突变的Ire1p蛋白质,其中一个缺乏其内腔的N-末端寡聚化结构域(δIre1p)。然后两个杂交蛋白之间的相互作用重建Ire1p二聚体,从而激活UPR下游信号传导。
下表总结了不同类型的Y2H系统及其特异性。
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